书名：基于深度学习的生命科学

作者：Bharath Ramsundar, Peter Eastman, Patrick Walters, Vijay Pande 著

译者：李新叶 译

国内出版社：中国电力出版社

出版时间：2020年06月

页数：228

书号：978-7-5198-4594-0

原版书书名：Deep Learning for the Life Sciences

原版书出版商：O'Reilly Media

 

Bharath Ramsundar是一家区块链公司Datamined的联合创始人和首席技术官，该公司支持构建大型生物数据集。Datamined旨在构建促进生物技术人工智能持续繁荣所需的数据集。Bharath也是Deepchem.io的主要开发人员和创建者，Deepchem.io是一个基于TensorFlow的开放源代码包，利用软件包可使更多人将深度学习应用到药物发现中。Bharath同时也是Moleclenet基准套件的共同创建者。
Bharath获得了UC Berkeley的电气工程与计算机科学以及数学专业的学士学位，并在数学专业毕业班上做告别致辞。他最近在Pande group集团支持下在Stanford University（除论文外）完成了计算机科学博士学位，获得了Hertz奖学金，这是科学界筛选最严格的研究生奖学金。

 

 

 

Peter Eastman在Stanford University生物工程系工作，为生物学家和化学家开发软件。他是高性能分子动力学模拟工具包OpenMM的主要作者，也是DeepChem的核心开发人员，DeepChem是一个用于化学、生物学和材料科学的深度学习软件包。他自2000年以来一直是一名专业的软件工程师，曾任生物信息学软件公司Silicon Genetics的工程副总裁。Peter目前研究兴趣主要集中在物理和深度学习之间的交叉研究。

 

 

 

Patrick Walters是马萨诸塞州剑桥市Relay Therapeutics公司计算和信息学小组的组长。他的团队专注于计算方法的新应用，这些方法整合了计算机模拟数据和实验数据，以提供推动药物发现计划的见解。在加入Relay公司之前，他在Vertex Pharmaceuticals工作了20多年，担任建模和信息学（Modeling and Informatics）全球主管。
Pat是期刊《Journal of Medicinal Chemistry》编辑咨询委员会的成员，曾在《Molecular Informatics》和《Letters in Drug Design & Discovery》担任过类似的角色。此后，他继续在科学界发挥积极作用。Pat是2017年戈登计算机辅助药物设计会议（Gordon Conference on Computer-Aided Drug Design）的主席，并参与了许多社区驱动的评估计算方法的工作，包括NIH资助的药物设计数据资源（D3R）和美国化学学会的TDT倡议。Pat在University of Arizona获得了有机化学博士学位，在那里他研究了人工智能在构象分析中的应用。在获得博士学位之前，他曾在Varian Instruments公司担任化学家和软件开发人员。Pat曾在University of California, Santa Barbara获得化学学士学位。

 

 

 

Vijay Pande博士是Andreessen Horowitz公司的合伙人，他带领该公司投资生物学和计算机科学交叉领域，包括将计算、机器学习和人工智能应用于生物学和医疗保健，以及对一些新的变革性科学进展的应用。他还是Stanford生物工程系的兼职教授，为开创性的计算方法及其在医学和生物学中的应用提供建议，发表了200多篇论文、2项专利和2种新型药物治疗。
作为一名企业家，Vijay是Folding@Home 分布式计算项目疾病研究的创始人，该项目推动计算机科学技术（如分布式系统、机器学习和奇特的计算机体系结构）在生物学和医学领域的发展和应用，包括基础研究和新疗法的开发。他还共同创立了Globavir Biosciences公司，将他在Stanford和Folding@Home的研究成果转化为一家成功的初创公司，发现了治疗登革热和埃博拉病毒的方法。在他十几岁的时候，他是电玩初创公司淘气狗软件（Naughty Dog Software）公司的第一位员工，该公司是Crash Bandicoot的制造商。

 

 

本书的封面动物是一种雄性索纳拉特原鸡（学名：Gallus Sonneratii），也被称为灰原鸡。物种命名为sonneratii是为了纪念法国博物学家和探险家Pierre Sonnerat。索纳拉特原鸡原产于印度南部和西部，在1774年~1781年，索纳拉特曾多次访问这里。灰原鸡的自然栖息地是森林下层和竹林，但它们可在多种环境中繁衍生息，包括森林、热带环境和平原。
大部分索纳拉特原鸡的羽毛有白色和棕色组成的美丽斑纹，其翅膀和尾巴顶端的黑色羽毛闪着蓝色光泽。雄性和雌性灰原鸡在许多方面有很大的不同。雄性灰原鸡长约30英寸，雌性灰原鸡长约15英寸；雄性灰原鸡比雌性灰原鸡羽毛颜色更明亮，有着光滑的尾巴、金色斑点，还有红色的鸡冠、腿和肉垂。雌性灰原鸡的腿是黄色的，羽毛是暗褐色的。
小鸡们出生后的颜色从浅棕色到米色不等。母鸡通常在2月~5月期间产卵，一般产卵4~7个。它们把卵产在地上铺有草和树枝的巢中，在没有公鸡帮助的情况下独自孵化。
索纳拉特原鸡是家养鸡的祖先。它们可以与普通鸡和红色的原鸡（都属Gallus gallus）交配，生出多种杂交品种。家养时，应该把它们安置在坚固的墙壁周围，因为它们易受到惊吓。它们的棕色和白色斑点羽毛常被渔民用来捕蝇。
O’Reilly书籍封面的许多动物都是濒危动物，它们都是世界上重要的动物。想了解更多关于怎样帮助濒危动物的知识，请访问animals.oreilly.com网站。
封面插图来自Karen Montgomery，基于Wood’s Illustrated Natural History中的一个黑白雕刻。